85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2279 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 1438 aa  2923    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  34.57 
 
 		 969 aa  253  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.73 
 
 		 1523 aa  188  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.51 
 
 		 1454 aa  165  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  23.3 
 
 		 1144 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  24.88 
 
 		 1280 aa  94.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  24.62 
 
 		 1243 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  24.24 
 
 		 1484 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3131  NB-ARC domain-containing protein  24.84 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  25.56 
 
 		 946 aa  72.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  31.32 
 
 		 992 aa  70.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  22.04 
 
 		 1427 aa  70.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5170  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1513 aa  69.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  21.42 
 
 		 690 aa  68.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  22.9 
 
 		 1001 aa  67.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  25.77 
 
 		 930 aa  66.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2043  tetratricopeptide domain-containing protein  21.14 
 
 		 1497 aa  66.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  23.12 
 
 		 919 aa  63.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.21 
 
 		 921 aa  63.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  25.46 
 
 		 921 aa  60.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 934 aa  59.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 910 aa  59.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  23.01 
 
 		 1003 aa  59.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  24.52 
 
 		 838 aa  59.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  24.1 
 
 		 913 aa  58.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  25.81 
 
 		 612 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  22.88 
 
 		 981 aa  58.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  20.49 
 
 		 827 aa  57.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 632 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  23.25 
 
 		 910 aa  57.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  22.05 
 
 		 908 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  23.18 
 
 		 757 aa  57  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  22.26 
 
 		 915 aa  55.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  24.76 
 
 		 994 aa  55.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1502 aa  55.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 775 aa  54.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1869 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  21.03 
 
 		 964 aa  53.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  36.45 
 
 		 471 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 973 aa  53.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  23.58 
 
 		 940 aa  52.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  23.4 
 
 		 990 aa  52.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  23.21 
 
 		 992 aa  52  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.99 
 
 		 631 aa  51.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2772  AAA ATPase  23.1 
 
 		 466 aa  51.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  22.89 
 
 		 937 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  26.26 
 
 		 967 aa  51.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 1731 aa  51.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1958 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  21.87 
 
 		 1008 aa  50.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 973 aa  50.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  24.26 
 
 		 1010 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  25.9 
 
 		 1003 aa  50.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 621 aa  50.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  24.88 
 
 		 928 aa  49.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 802 aa  49.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  22.08 
 
 		 783 aa  48.9  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 502 aa  49.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  20 
 
 		 779 aa  49.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 		 742 aa  48.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  22.34 
 
 		 978 aa  48.5  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  26.03 
 
 		 1138 aa  48.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  26.89 
 
 		 775 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  27.03 
 
 		 970 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  20.11 
 
 		 916 aa  48.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 1185 aa  48.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  25.89 
 
 		 1004 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  23.76 
 
 		 814 aa  47.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.13 
 
 		 1494 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  23.61 
 
 		 1011 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54586  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1525 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 462 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  25.27 
 
 		 1024 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  24 
 
 		 1020 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  23.45 
 
 		 816 aa  46.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  21.33 
 
 		 996 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  22.67 
 
 		 680 aa  45.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  22.07 
 
 		 941 aa  45.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 1221 aa  46.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  24.42 
 
 		 1030 aa  45.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1010 aa  45.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  22.98 
 
 		 1022 aa  45.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  30.28 
 
 		 462 aa  45.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  23.72 
 
 		 788 aa  45.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 1262 aa  45.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>