33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0836 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  99.81 
 
 		 519 aa  1069    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1271    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  29.24 
 
 		 377 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  29.46 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.36 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  29.66 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  25.53 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.69 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4060  hypothetical protein  35.96 
 
 		 149 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  26.32 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.51 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  26.86 
 
 		 461 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.95 
 
 		 286 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.44 
 
 		 286 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  23.94 
 
 		 541 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  23.61 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  22.91 
 
 		 606 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  22.47 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  25.76 
 
 		 474 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  23.38 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.56 
 
 		 290 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  21.71 
 
 		 293 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  31.31 
 
 		 684 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  26.47 
 
 		 328 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  29.03 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.29 
 
 		 272 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  26.36 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  26.82 
 
 		 746 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  22.45 
 
 		 689 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  25.21 
 
 		 532 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  23.86 
 
 		 514 aa  43.9  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  25.87 
 
 		 358 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>