54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0345 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  949    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  34.73 
 
 		 541 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  31.42 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  31.21 
 
 		 511 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  32 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  31.44 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.41 
 
 		 272 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.09 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  28.5 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.57 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.25 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  29.79 
 
 		 328 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  29.67 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  30.27 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1199 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  27.84 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  27.18 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25.24 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.5 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  27 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  23.86 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  29.5 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  28.92 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  29.86 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  26.17 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  26.79 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  27.1 
 
 		 603 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  27.1 
 
 		 603 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1242 aa  50.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  27.27 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  24.79 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  25.76 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.87 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  25.76 
 
 		 519 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1264 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1264 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1160 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1319 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  25.64 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  26.01 
 
 		 480 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  27.78 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  25.44 
 
 		 532 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1160 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  25.84 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1160 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  25.35 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1166 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0019  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1320 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.831079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  24.14 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1161 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1160 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  23.43 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>