17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5667 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  100 
 
 
746 aa  1465    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  29.82 
 
 
290 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  27.99 
 
 
1199 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25.33 
 
 
294 aa  54.7  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  30.49 
 
 
541 aa  54.3  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  25.11 
 
 
435 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  28.83 
 
 
484 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  28.96 
 
 
497 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  26.16 
 
 
442 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  24.34 
 
 
500 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  26.69 
 
 
606 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  31.93 
 
 
358 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  20.96 
 
 
906 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  21.48 
 
 
518 aa  49.7  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  26.4 
 
 
377 aa  49.3  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  26.61 
 
 
519 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  26.61 
 
 
613 aa  44.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>