71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2483 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  100 
 
 
286 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  64.23 
 
 
286 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  59.4 
 
 
272 aa  344  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  53.41 
 
 
328 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  48.47 
 
 
263 aa  274  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  28.52 
 
 
275 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  29.2 
 
 
500 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  32.22 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  24.91 
 
 
497 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  31.62 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  28.62 
 
 
906 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  29.46 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  32.03 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.67 
 
 
632 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  27.05 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  26.44 
 
 
477 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.81 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  29.57 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  28.93 
 
 
511 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  28.93 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.24 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  25.17 
 
 
476 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.57 
 
 
482 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  26.52 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  27.87 
 
 
511 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  30.95 
 
 
305 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  30.88 
 
 
1160 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  30.88 
 
 
1170 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  30.88 
 
 
1170 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  30.88 
 
 
1160 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  30.88 
 
 
1160 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  30.88 
 
 
1161 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  30.88 
 
 
1160 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  25.65 
 
 
441 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  26.76 
 
 
541 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  30.33 
 
 
1166 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  26.02 
 
 
377 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  25.95 
 
 
519 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  33.6 
 
 
480 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  25.95 
 
 
613 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  27.59 
 
 
1036 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  29.05 
 
 
1160 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  24.76 
 
 
442 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  31.58 
 
 
358 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  34.51 
 
 
516 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  27.83 
 
 
1199 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  28.18 
 
 
461 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  23.9 
 
 
514 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  22.58 
 
 
537 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  23.17 
 
 
518 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  27.45 
 
 
1319 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  27.82 
 
 
540 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  22.09 
 
 
532 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3532  hypothetical protein  28.91 
 
 
792 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  22.57 
 
 
459 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  24.03 
 
 
838 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  26.61 
 
 
534 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  25.43 
 
 
603 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  25.43 
 
 
603 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  32.04 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  24.02 
 
 
606 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  25.62 
 
 
538 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  25.62 
 
 
538 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  25.54 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  24.56 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  21.03 
 
 
435 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  23.9 
 
 
436 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  26.22 
 
 
588 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0019  hypothetical protein  23.61 
 
 
1320 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.831079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  24.45 
 
 
1242 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>