27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0925 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  950    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4060  hypothetical protein  37.78 
 
 		 149 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  27.91 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  40.86 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  34.82 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  40.62 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  40.86 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  26.86 
 
 		 613 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  34.15 
 
 		 519 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.03 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.09 
 
 		 484 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.18 
 
 		 286 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  23.13 
 
 		 541 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  27.08 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  23.18 
 
 		 746 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  25.49 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  23.36 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  26.7 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  22.26 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.7 
 
 		 632 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  26.74 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  32.26 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  33.93 
 
 		 518 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  21.23 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>