58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6572 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  41.36 
 
 
442 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  25.41 
 
 
532 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  26.57 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  30.08 
 
 
290 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  33.64 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  31.93 
 
 
541 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  25.23 
 
 
1199 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25.85 
 
 
500 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  28.8 
 
 
1282 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  29.48 
 
 
441 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.95 
 
 
481 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  29.68 
 
 
534 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.67 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  31.37 
 
 
1166 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  31.58 
 
 
286 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.8 
 
 
632 aa  53.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  30.28 
 
 
275 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  25 
 
 
435 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  31.93 
 
 
746 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  29.84 
 
 
906 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  28.43 
 
 
516 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  29.93 
 
 
476 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  25.57 
 
 
482 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  27.97 
 
 
537 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  28.43 
 
 
1170 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  28.43 
 
 
1170 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  27.34 
 
 
480 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  28.43 
 
 
1160 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  28.8 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  27.34 
 
 
511 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  29.29 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  24.71 
 
 
479 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  27.34 
 
 
511 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  27.86 
 
 
268 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  32.03 
 
 
272 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  28.43 
 
 
305 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  26.7 
 
 
328 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.96 
 
 
286 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  26.57 
 
 
540 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  27.45 
 
 
1160 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  27.45 
 
 
1160 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  27.45 
 
 
1160 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  27.59 
 
 
538 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  27.59 
 
 
538 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  29.17 
 
 
484 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  28.49 
 
 
1183 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  24.67 
 
 
689 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  28.43 
 
 
1161 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  29.85 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  32.73 
 
 
1116 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  24.05 
 
 
459 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  27.45 
 
 
1160 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  25.87 
 
 
613 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  26.17 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  25.87 
 
 
519 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  26.32 
 
 
504 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  24.06 
 
 
518 aa  42.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>