72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3820 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1041    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  34.73 
 
 		 474 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  35.78 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  34.64 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  36.63 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  29.46 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  30 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  27.7 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  32 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  30.14 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  31.58 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  30.37 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  31.65 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.7 
 
 		 632 aa  73.9  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1199 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  31.91 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  24.81 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  31.34 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  28.25 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  31.8 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.43 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.29 
 
 		 286 aa  67  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  28.7 
 
 		 540 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.74 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  24.32 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  27.43 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  26.09 
 
 		 906 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  29.82 
 
 		 436 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  29.72 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  28.57 
 
 		 746 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  30 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  28.84 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  24.42 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.73 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1160 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  24.7 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1160 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  25 
 
 		 519 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  24.3 
 
 		 613 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1170 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1170 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  29.03 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  26.2 
 
 		 516 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1161 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1160 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  19.85 
 
 		 532 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1166 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1160 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  23.73 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  25.78 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  25.69 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  30.97 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  23.14 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  23.19 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  29.2 
 
 		 306 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  27.35 
 
 		 441 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1319 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  29.2 
 
 		 306 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  26.98 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  23.01 
 
 		 480 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  22.85 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  27.12 
 
 		 541 aa  47  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  28.8 
 
 		 306 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  27.83 
 
 		 538 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  27.83 
 
 		 538 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4060  hypothetical protein  26.61 
 
 		 149 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  26.6 
 
 		 321 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  28.48 
 
 		 559 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  27.67 
 
 		 897 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9525  hypothetical protein  32.2 
 
 		 625 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.771894  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0019  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1320 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.831079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>