55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1597 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  100 
 
 		 286 aa  587  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  64.23 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  55.38 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  51.46 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  50.19 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  29.34 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  31.4 
 
 		 500 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  24.91 
 
 		 497 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  29.79 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  26.64 
 
 		 906 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  27.65 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  27.65 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  30.04 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.56 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  29.41 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  27.43 
 
 		 476 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  30.57 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  26.27 
 
 		 511 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  30.48 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  29.61 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  26.27 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  26.27 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.12 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  27.73 
 
 		 838 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  26.5 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  26.48 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  25.63 
 
 		 442 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  24.05 
 
 		 541 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  27.03 
 
 		 461 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  29.5 
 
 		 518 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  34.55 
 
 		 480 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  23.4 
 
 		 519 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  26.44 
 
 		 613 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  26.01 
 
 		 516 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  24.75 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1319 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  22.41 
 
 		 532 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  24 
 
 		 606 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  25.72 
 
 		 538 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  25.72 
 
 		 538 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  22.12 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  28.57 
 
 		 537 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  29.84 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  21.58 
 
 		 1036 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  24.41 
 
 		 514 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  25.19 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1267 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  28.44 
 
 		 716 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  26.7 
 
 		 588 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3532  hypothetical protein  25.62 
 
 		 792 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  30.43 
 
 		 534 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  26.95 
 
 		 689 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  27.74 
 
 		 541 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>