20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0228 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 1036 aa  2134    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  21.31 
 
 		 838 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3054  hypothetical protein  22.83 
 
 		 881 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00156029  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  22.08 
 
 		 716 aa  76.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.81 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3532  hypothetical protein  26.67 
 
 		 792 aa  55.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.59 
 
 		 286 aa  55.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.41 
 
 		 290 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  24.73 
 
 		 302 aa  48.9  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  25.34 
 
 		 541 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2863  hypothetical protein  22.08 
 
 		 921 aa  47  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  23.08 
 
 		 263 aa  47  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  25.28 
 
 		 496 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  26.13 
 
 		 484 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  21.58 
 
 		 286 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  22.62 
 
 		 275 aa  46.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  25.22 
 
 		 452 aa  46.2  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  25.87 
 
 		 532 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1199 aa  45.8  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  26.51 
 
 		 540 aa  44.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>