48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0138 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  97.39 
 
 
306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  96.73 
 
 
306 aa  573  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  71.95 
 
 
323 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  28.94 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  31.88 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  23.44 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30.77 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.65 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  31.36 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  30 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  30 
 
 
497 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  24.34 
 
 
477 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  24.89 
 
 
481 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  20.94 
 
 
632 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  22.08 
 
 
479 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.78 
 
 
482 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  30.64 
 
 
511 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  30.04 
 
 
480 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  30.04 
 
 
511 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.23 
 
 
484 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  24.3 
 
 
518 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1168  hypothetical protein  22.77 
 
 
549 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  23.01 
 
 
476 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  31.82 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  26.69 
 
 
442 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  28.28 
 
 
441 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  30 
 
 
606 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  25.31 
 
 
1166 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  25.73 
 
 
305 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  25.73 
 
 
1160 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  23.21 
 
 
716 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  29.1 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  25.73 
 
 
1160 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  25.73 
 
 
1170 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  25.73 
 
 
1170 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  25.73 
 
 
1160 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  29.23 
 
 
496 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  24.32 
 
 
532 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  25.73 
 
 
1161 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  25.31 
 
 
1160 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  24.9 
 
 
1160 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  26.09 
 
 
538 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  26.09 
 
 
538 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  25.42 
 
 
603 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  25.42 
 
 
603 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  27.2 
 
 
541 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  22.81 
 
 
534 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>