47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1068 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  1001    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  46.12 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  41.19 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  41.32 
 
 		 321 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  30.62 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  34.04 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  34.04 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  32.5 
 
 		 516 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  33.03 
 
 		 524 aa  150  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  35.62 
 
 		 540 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  31.41 
 
 		 534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  29.36 
 
 		 537 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  22.56 
 
 		 532 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  29.36 
 
 		 518 aa  90.1  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  33.66 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  26.32 
 
 		 328 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  33.6 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  32.73 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  26.96 
 
 		 263 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  32.14 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  30.46 
 
 		 514 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  31.48 
 
 		 484 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  26.67 
 
 		 302 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  31.82 
 
 		 632 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  34.55 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  22.55 
 
 		 906 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  27.08 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  35.29 
 
 		 325 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1199 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.21 
 
 		 290 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  29.25 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  29.25 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  28.19 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  29.25 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  32.43 
 
 		 293 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  26.01 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  29.29 
 
 		 541 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  26.5 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  26.25 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  27.4 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  30.23 
 
 		 746 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  26.53 
 
 		 275 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  25.51 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  33.67 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 1036 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  27.19 
 
 		 323 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  34.95 
 
 		 716 aa  43.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>