22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0072 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 838 aa  1715    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  21.31 
 
 		 1036 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  30.63 
 
 		 479 aa  77.4  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  27.27 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.26 
 
 		 482 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  26.03 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.72 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.73 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.99 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.23 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  26.47 
 
 		 275 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  23.5 
 
 		 290 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  25.97 
 
 		 263 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.89 
 
 		 272 aa  51.6  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  29.46 
 
 		 716 aa  51.6  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  24.15 
 
 		 323 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.03 
 
 		 286 aa  48.5  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  23.94 
 
 		 435 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25.11 
 
 		 294 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3054  hypothetical protein  20.98 
 
 		 881 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00156029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  26.71 
 
 		 325 aa  45.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  23.25 
 
 		 441 aa  44.3  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>