24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6326 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  100 
 
 		 1267 aa  2582    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  45.05 
 
 		 734 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1242 aa  348  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0740  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1269 aa  337  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3856  hypothetical protein  28.73 
 
 		 589 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1264 aa  171  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1264 aa  171  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  34.76 
 
 		 1282 aa  169  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6508  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1197 aa  137  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  34.08 
 
 		 606 aa  135  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1183 aa  128  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1116 aa  115  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1161 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1160 aa  112  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1170 aa  112  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1170 aa  112  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1160 aa  112  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1160 aa  111  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  30.03 
 
 		 305 aa  109  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1166 aa  108  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1160 aa  108  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1160 aa  107  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4329  hypothetical protein  35.16 
 
 		 519 aa  52.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.982381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  27.39 
 
 		 325 aa  50.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>