31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0224 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  43.57 
 
 
1282 aa  1051    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  100 
 
 
1264 aa  2581    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  100 
 
 
1264 aa  2581    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4329  hypothetical protein  46.89 
 
 
519 aa  452  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.982381  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  40.43 
 
 
606 aa  215  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0740  hypothetical protein  23.76 
 
 
1269 aa  200  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  35.64 
 
 
734 aa  174  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  37.91 
 
 
1267 aa  171  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  28.73 
 
 
1242 aa  136  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  29.63 
 
 
1183 aa  127  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  27.4 
 
 
1161 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  32.6 
 
 
1116 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  27.4 
 
 
1160 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  27.59 
 
 
1160 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  27.94 
 
 
1166 aa  119  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  27.12 
 
 
1160 aa  119  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6508  hypothetical protein  29.51 
 
 
1197 aa  118  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  27.3 
 
 
1160 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  27.3 
 
 
1170 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  28.24 
 
 
1160 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  27.3 
 
 
1170 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  29.61 
 
 
305 aa  118  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6363  hypothetical protein  21.5 
 
 
556 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0751513  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.82 
 
 
632 aa  58.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  28.9 
 
 
511 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  28.9 
 
 
480 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  30.28 
 
 
511 aa  55.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  52.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  24.64 
 
 
474 aa  48.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2749  hypothetical protein  17.84 
 
 
849 aa  48.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  19.55 
 
 
435 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>