22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6508 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6508  hypothetical protein  100 
 
 		 1197 aa  2411    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1282 aa  216  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1267 aa  144  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  33.45 
 
 		 606 aa  138  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  32.32 
 
 		 734 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1264 aa  126  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1264 aa  126  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0740  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1269 aa  124  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1242 aa  122  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1166 aa  105  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1161 aa  105  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1170 aa  101  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1160 aa  101  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1170 aa  101  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1160 aa  101  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  28.34 
 
 		 305 aa  99.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1160 aa  99  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1160 aa  99  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1160 aa  97.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1116 aa  86.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1183 aa  78.2  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4329  hypothetical protein  22.88 
 
 		 519 aa  63.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.982381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>