63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0167 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1254    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25.1 
 
 		 481 aa  89  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  23.42 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  26.46 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30.04 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.37 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.67 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  25.36 
 
 		 613 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  25.36 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  26.61 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  25.75 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  25.33 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 1036 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  27.19 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  25.25 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  25.63 
 
 		 480 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  25.63 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.77 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  25.56 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  25.49 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  21.37 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  21.58 
 
 		 293 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  26.13 
 
 		 511 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  26.12 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  28.38 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  21.37 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  26.99 
 
 		 838 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  20.94 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  24.66 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1199 aa  58.9  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1264 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1264 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  22.94 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3661  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1282 aa  58.5  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  27.73 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.79 
 
 		 294 aa  57  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  32.14 
 
 		 452 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1242 aa  54.7  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  27.09 
 
 		 906 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  31.82 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  26.8 
 
 		 358 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  27.6 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  23.08 
 
 		 606 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  26.85 
 
 		 302 aa  50.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  24.44 
 
 		 377 aa  50.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  30.91 
 
 		 500 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  34.58 
 
 		 532 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  31.67 
 
 		 716 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  29.36 
 
 		 516 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  31.71 
 
 		 459 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  30.85 
 
 		 497 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0740  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1269 aa  47.4  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  25.7 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1116 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  26.5 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  30.91 
 
 		 541 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0019  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1320 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.831079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  34.26 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  26.72 
 
 		 538 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  26.72 
 
 		 538 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  25.56 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  28.69 
 
 		 321 aa  43.9  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1183 aa  43.9  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>