60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0849 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  99.79 
 
 
511 aa  950    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  87.32 
 
 
511 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  950    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  36.75 
 
 
541 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  32 
 
 
474 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.85 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  30.9 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.16 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  28.64 
 
 
500 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  29.8 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.87 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.93 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.27 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.63 
 
 
632 aa  66.6  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  29.73 
 
 
484 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  24.89 
 
 
534 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  26.82 
 
 
479 aa  63.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  25.68 
 
 
482 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  29.63 
 
 
1199 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  28.8 
 
 
497 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  26.04 
 
 
906 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  28.9 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0224  hypothetical protein  28.9 
 
 
1264 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2883  hypothetical protein  28.9 
 
 
1264 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  24.9 
 
 
540 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  24.2 
 
 
538 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  24.2 
 
 
538 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  22.41 
 
 
537 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  53.5  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  30.04 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  28.33 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  29.91 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  28.01 
 
 
293 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  21.97 
 
 
541 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  25.82 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  22.41 
 
 
516 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  29.25 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  26.61 
 
 
323 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  29.35 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  24.88 
 
 
377 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  27.34 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25.7 
 
 
294 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0643  hypothetical protein  28.23 
 
 
1183 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  21.63 
 
 
275 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  29.56 
 
 
1160 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  29.56 
 
 
1170 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  29.56 
 
 
1170 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  26.44 
 
 
588 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  29.56 
 
 
1160 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  29.13 
 
 
1242 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  24.21 
 
 
532 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  29.7 
 
 
1160 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  22.27 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  29.17 
 
 
290 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  29.56 
 
 
1161 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  33.67 
 
 
325 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  27.86 
 
 
1166 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  28.43 
 
 
1160 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>