43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3482 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  662    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  34.25 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  30.63 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  21.83 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  34.38 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  35.25 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  28.89 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  22.94 
 
 		 632 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1199 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.36 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  31.8 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.66 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  35.51 
 
 		 480 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  24.24 
 
 		 500 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  23.04 
 
 		 452 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  31.31 
 
 		 541 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  32.74 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  29.86 
 
 		 474 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  32.74 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  27.4 
 
 		 479 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  33.6 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  23.26 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1267 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  32.28 
 
 		 511 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  26.16 
 
 		 497 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  30.7 
 
 		 484 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  27.67 
 
 		 734 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  25.56 
 
 		 435 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  31.67 
 
 		 480 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  26.09 
 
 		 409 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  31.67 
 
 		 511 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0740  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1269 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  26 
 
 		 838 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  27.51 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  24.37 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  26.39 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  24.51 
 
 		 1036 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  27.08 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  28.68 
 
 		 459 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  28.3 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.1 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4463  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1116 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>