59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0266 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  50.19 
 
 
286 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  48.47 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  42.8 
 
 
272 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  38.55 
 
 
328 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  31.17 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  28.91 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  30.51 
 
 
323 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  28.94 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  26.89 
 
 
497 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  28.09 
 
 
306 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  28.09 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  31.47 
 
 
906 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  27.32 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  23.64 
 
 
476 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25.96 
 
 
481 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  23.92 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.38 
 
 
484 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  23.9 
 
 
541 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  22.43 
 
 
482 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  24.9 
 
 
511 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  25 
 
 
480 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  27.75 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.73 
 
 
290 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.12 
 
 
632 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  27 
 
 
474 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25.41 
 
 
294 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  23.7 
 
 
511 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  22.71 
 
 
377 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  21.83 
 
 
441 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  26.96 
 
 
480 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  22.51 
 
 
518 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  29.82 
 
 
603 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  29.82 
 
 
603 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  25.97 
 
 
838 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1600  hypothetical protein  40.3 
 
 
351 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  28.8 
 
 
358 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  21.34 
 
 
606 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  25.82 
 
 
435 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  23.08 
 
 
1036 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  20.56 
 
 
537 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  28.71 
 
 
532 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  27.49 
 
 
1160 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  27.49 
 
 
1170 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  27.49 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  27.49 
 
 
1160 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  27.49 
 
 
1170 aa  45.4  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  24.34 
 
 
442 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  27.49 
 
 
1161 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  32.35 
 
 
516 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  24.91 
 
 
452 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  27.1 
 
 
1160 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  21.46 
 
 
519 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  24.36 
 
 
716 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  21.46 
 
 
613 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  27.1 
 
 
1160 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  27.57 
 
 
1166 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  23.26 
 
 
325 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0328  hypothetical protein  25.44 
 
 
1242 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>