21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1324 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 716 aa  1467    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  22.08 
 
 		 1036 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.35 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  26.36 
 
 		 484 aa  55.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  28.21 
 
 		 481 aa  54.3  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  29.46 
 
 		 838 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  30.99 
 
 		 532 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  27.59 
 
 		 479 aa  50.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  25.89 
 
 		 323 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  27.27 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  31.67 
 
 		 632 aa  48.5  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  29.63 
 
 		 593 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  23.21 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3532  hypothetical protein  27.83 
 
 		 792 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  23.21 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  23.21 
 
 		 306 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  25.45 
 
 		 482 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0435  hypothetical protein  28.57 
 
 		 506 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3591  hypothetical protein  28.4 
 
 		 97 aa  44.3  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  29.33 
 
 		 290 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.44 
 
 		 286 aa  43.9  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>