19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4271 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  100 
 
 
593 aa  1216    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  29.85 
 
 
597 aa  243  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  40.07 
 
 
588 aa  219  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2243  hypothetical protein  36.43 
 
 
599 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1888  hypothetical protein  36.68 
 
 
593 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  29.57 
 
 
578 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  27.45 
 
 
591 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3439  hypothetical protein  25.65 
 
 
677 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  30.69 
 
 
579 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  25.42 
 
 
1063 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02322  hypothetical protein  25.79 
 
 
888 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1360  hypothetical protein  25.3 
 
 
587 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  24.17 
 
 
670 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  24.75 
 
 
906 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  29.63 
 
 
716 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  23.33 
 
 
559 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  23.33 
 
 
897 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1278  putative lipoprotein  21.98 
 
 
624 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  24.34 
 
 
606 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>