55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4173 on replicon NC_013518
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  963    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  47.64 
 
 
481 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  43.58 
 
 
477 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  45.6 
 
 
476 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  45.18 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  30.88 
 
 
484 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0314  hypothetical protein  30.24 
 
 
210 aa  86.3  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0663161  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0169  hypothetical protein  34.21 
 
 
211 aa  85.1  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.917424  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0275  hypothetical protein  31.22 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00635248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  26.67 
 
 
436 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  30.63 
 
 
838 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  30 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  27.62 
 
 
1199 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  28.5 
 
 
328 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  27.32 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.41 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.91 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.05 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  23.98 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  28.5 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  27.19 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  24.62 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  26.32 
 
 
1319 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  29.06 
 
 
275 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  27.78 
 
 
511 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  26.82 
 
 
511 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  26.82 
 
 
480 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25.57 
 
 
500 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  25.11 
 
 
302 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  27.18 
 
 
906 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  22.08 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  22.02 
 
 
306 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  19.83 
 
 
323 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  24.06 
 
 
293 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  21.74 
 
 
442 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  21.7 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  27.59 
 
 
716 aa  50.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  28.37 
 
 
518 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  23.38 
 
 
613 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  23.08 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  23.38 
 
 
519 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  22.03 
 
 
290 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  26.7 
 
 
461 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  24.64 
 
 
538 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  24.64 
 
 
538 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4060  hypothetical protein  33.64 
 
 
149 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  24.71 
 
 
358 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  29.82 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  24.19 
 
 
532 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  25.14 
 
 
516 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  22.79 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  29.27 
 
 
243 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1168  hypothetical protein  30.63 
 
 
549 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  26.02 
 
 
435 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  25 
 
 
524 aa  43.5  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>