24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2487 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  862    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25.75 
 
 		 294 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  26.67 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  30.47 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  29.31 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  25.23 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  22.89 
 
 		 906 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  25.66 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  29.82 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  28.81 
 
 		 484 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  25.82 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  26.89 
 
 		 328 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  27.27 
 
 		 474 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.9 
 
 		 272 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  25.82 
 
 		 511 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  25.82 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  26.36 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  26.83 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  23.58 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  25.51 
 
 		 480 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  21.23 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  23.9 
 
 		 286 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>