50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2550 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  620  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  48.49 
 
 
293 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  39.87 
 
 
504 aa  228  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  31.89 
 
 
689 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1159  hypothetical protein  30.19 
 
 
392 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  34.6 
 
 
268 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  28.14 
 
 
684 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  25.4 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  26.97 
 
 
482 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  25.38 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  26.38 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.82 
 
 
481 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  24.89 
 
 
500 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  25.11 
 
 
479 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  26.32 
 
 
511 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  26.32 
 
 
480 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.74 
 
 
484 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  28.85 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  25.08 
 
 
511 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  27.43 
 
 
541 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  26.67 
 
 
480 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  28.21 
 
 
409 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.86 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.85 
 
 
632 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  26.51 
 
 
1166 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  25.81 
 
 
275 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  25.3 
 
 
1160 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  24.73 
 
 
1036 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  25.3 
 
 
1170 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  25.3 
 
 
1170 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  25.7 
 
 
1160 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  25.3 
 
 
1160 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  27.27 
 
 
1160 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  28.57 
 
 
537 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  25.69 
 
 
1160 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  24.5 
 
 
1161 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  25.61 
 
 
538 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  25.61 
 
 
538 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  26.06 
 
 
541 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  29.1 
 
 
306 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  29.1 
 
 
306 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  21.34 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  25 
 
 
552 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  25 
 
 
552 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  23.58 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  25.2 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.54 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  26.14 
 
 
497 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  25.95 
 
 
540 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  22.81 
 
 
532 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>