49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1653 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1038    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  37.43 
 
 		 497 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30.35 
 
 		 272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  31.11 
 
 		 328 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  31.4 
 
 		 286 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.2 
 
 		 286 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  28.91 
 
 		 263 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  23.83 
 
 		 306 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  29.82 
 
 		 275 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  23.83 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  23.44 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  26.64 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  27.91 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  29.33 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  28.64 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  28.64 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.95 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  27.59 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  25.51 
 
 		 906 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  27.98 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  27.48 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25.5 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  27.91 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  25.57 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  25.24 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  24.89 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1199 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.47 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  26.76 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  32.14 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1319 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  22.87 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  24.34 
 
 		 746 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  23.16 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  24.24 
 
 		 325 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  22.57 
 
 		 377 aa  50.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  30.91 
 
 		 632 aa  50.4  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  24.02 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  22.99 
 
 		 689 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  30.71 
 
 		 538 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  30.71 
 
 		 538 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  28.57 
 
 		 518 aa  47  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0703  hypothetical protein  27.95 
 
 		 768 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  29.33 
 
 		 591 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  25.32 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  27.51 
 
 		 838 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  22.53 
 
 		 514 aa  43.5  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>