17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2564 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  26.03 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  27.07 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  23.74 
 
 
377 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  27.22 
 
 
906 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  27.59 
 
 
441 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  24.02 
 
 
500 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  28.97 
 
 
497 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  29.27 
 
 
479 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  24.37 
 
 
325 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  23.58 
 
 
481 aa  45.4  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  33.33 
 
 
452 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  31.75 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  29.17 
 
 
632 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  34.33 
 
 
541 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  23.16 
 
 
519 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  23.16 
 
 
613 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>