40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4003 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1807    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30.98 
 
 		 272 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  31.75 
 
 		 328 aa  97.8  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  31.47 
 
 		 263 aa  90.1  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.62 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1319 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.64 
 
 		 286 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25.51 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  26.24 
 
 		 484 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  24.72 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  30.48 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.57 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  22.89 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.42 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  24.74 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.4 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  26.04 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  23.67 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  26.04 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  27.18 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  23.35 
 
 		 323 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  25.4 
 
 		 541 aa  57.4  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  24.47 
 
 		 511 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  25.96 
 
 		 497 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  27.09 
 
 		 632 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.75 
 
 		 482 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  22.55 
 
 		 480 aa  52.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  29.84 
 
 		 358 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  20.96 
 
 		 746 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1168  hypothetical protein  27.36 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  27.22 
 
 		 243 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  22.76 
 
 		 275 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  29.57 
 
 		 532 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1166 aa  48.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  24.75 
 
 		 593 aa  47  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1102  hypothetical protein  27.78 
 
 		 515 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0731  hypothetical protein  27.73 
 
 		 133 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  22.41 
 
 		 588 aa  44.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  23.87 
 
 		 452 aa  45.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1199 aa  44.3  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>