36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0957 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  925    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  46.12 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  42.98 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  45.4 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  34.65 
 
 		 524 aa  163  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  32.52 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  33.24 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  30.57 
 
 		 540 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 541 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  28.91 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  28.91 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  29.94 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  29.76 
 
 		 532 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 518 aa  94.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  39.39 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  24.8 
 
 		 328 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  32.14 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  22.49 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25 
 
 		 481 aa  53.5  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  20.09 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  24.56 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  23.04 
 
 		 325 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  21.95 
 
 		 541 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  25.22 
 
 		 1036 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  26.27 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  23.58 
 
 		 511 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  22.27 
 
 		 480 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  23.87 
 
 		 906 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  28.16 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  24.14 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  24.91 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  26.9 
 
 		 514 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  28.93 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  26.44 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  27.35 
 
 		 294 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>