36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2653 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  100 
 
 
538 aa  1117    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  100 
 
 
538 aa  1117    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  37.83 
 
 
541 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  37.52 
 
 
516 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  41.19 
 
 
524 aa  329  7e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  37.53 
 
 
537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  38.65 
 
 
540 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  28.84 
 
 
534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  34.04 
 
 
480 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  31.23 
 
 
459 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  28.91 
 
 
452 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  24.39 
 
 
532 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4811  putative phage-related protein  30.66 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  34.43 
 
 
321 aa  104  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  23.68 
 
 
518 aa  87.8  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  30.43 
 
 
409 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  31.55 
 
 
293 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  24.31 
 
 
511 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  24.2 
 
 
480 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  24.2 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  23.72 
 
 
476 aa  53.5  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.21 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  24.64 
 
 
479 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  22.98 
 
 
441 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  25.61 
 
 
302 aa  47.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.72 
 
 
286 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  25.37 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  30.71 
 
 
500 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30 
 
 
272 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.72 
 
 
632 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  35.71 
 
 
442 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  33.04 
 
 
328 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.62 
 
 
286 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  28.57 
 
 
1319 aa  44.3  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  32.2 
 
 
541 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  26.09 
 
 
306 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>