36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01367 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  952    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  42.98 
 
 
452 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  41.19 
 
 
480 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  38.87 
 
 
321 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  31.23 
 
 
538 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  31.23 
 
 
538 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  31.1 
 
 
541 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  28.66 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  29.59 
 
 
537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  30.46 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  29.61 
 
 
516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  35.65 
 
 
524 aa  130  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  25.08 
 
 
532 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  27.2 
 
 
518 aa  76.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  25.6 
 
 
275 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  32.23 
 
 
409 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  22.57 
 
 
286 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  24.82 
 
 
328 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  31.71 
 
 
632 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  29.92 
 
 
290 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  30.16 
 
 
442 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  25.64 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  25.17 
 
 
541 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.94 
 
 
484 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  24.02 
 
 
323 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25.34 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  28.86 
 
 
511 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  23.72 
 
 
306 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  23.05 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  24.05 
 
 
358 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  28.12 
 
 
746 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.35 
 
 
294 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.41 
 
 
272 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  29.13 
 
 
325 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  29.06 
 
 
480 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  31.75 
 
 
243 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>