26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0929 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  844    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  39.39 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  30.43 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  30.43 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  33.33 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  26.36 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  33.66 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  31.15 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  27.46 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  31.37 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  35.35 
 
 		 534 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.93 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  28.21 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  27.69 
 
 		 518 aa  50.8  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  27.33 
 
 		 524 aa  51.2  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  32.23 
 
 		 459 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  26.67 
 
 		 532 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  30.43 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  25.35 
 
 		 504 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  32.32 
 
 		 321 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  23.84 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  19.21 
 
 		 689 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  21.96 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  26.57 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  28.21 
 
 		 328 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>