35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0550 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1105    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  34.81 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  36.5 
 
 		 534 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  37.53 
 
 		 538 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  37.53 
 
 		 538 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  33.72 
 
 		 516 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  39.7 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  33.52 
 
 		 524 aa  253  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  30.11 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  32.52 
 
 		 452 aa  148  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  29.59 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  29.36 
 
 		 480 aa  127  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  40.48 
 
 		 321 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  28.62 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4811  putative phage-related protein  25.19 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  24.15 
 
 		 328 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  24.24 
 
 		 511 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  31.37 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  26.39 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.1 
 
 		 272 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  22.41 
 
 		 480 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  22.41 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.3 
 
 		 290 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  27.6 
 
 		 632 aa  52  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  26.73 
 
 		 541 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  24 
 
 		 442 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  22.58 
 
 		 286 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  30.67 
 
 		 294 aa  50.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  31.73 
 
 		 275 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  27.97 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.57 
 
 		 286 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  20.56 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  25.34 
 
 		 323 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  22.29 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>