33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2928 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  45.4 
 
 		 452 aa  285  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  38.87 
 
 		 459 aa  262  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  41.32 
 
 		 480 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  34.43 
 
 		 538 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  34.43 
 
 		 538 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  33.84 
 
 		 534 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  40.52 
 
 		 540 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  40.48 
 
 		 537 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  32.84 
 
 		 541 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  41.67 
 
 		 524 aa  96.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  35.04 
 
 		 516 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  37.7 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  26.67 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  26.76 
 
 		 514 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  26.5 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  30.19 
 
 		 484 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  30.69 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  29.84 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  32.32 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  26.74 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  32.04 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  30.89 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  26.6 
 
 		 541 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  26.05 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.36 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  28.69 
 
 		 632 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  27.56 
 
 		 906 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  24.3 
 
 		 480 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  24.3 
 
 		 511 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  24.3 
 
 		 511 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>