20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3815 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  742    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  45.93 
 
 		 135 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  43.26 
 
 		 584 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  41.72 
 
 		 942 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  44.19 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  37.41 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  35.33 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  35.57 
 
 		 320 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  34.01 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  37.16 
 
 		 250 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  33.33 
 
 		 260 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  34.48 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  30.16 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  32.35 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  24.66 
 
 		 183 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  24.59 
 
 		 585 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  34.33 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  26.09 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  34.33 
 
 		 552 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>