27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1477 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  100 
 
 		 183 aa  381  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  35.21 
 
 		 320 aa  98.2  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  35.46 
 
 		 325 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  35.88 
 
 		 320 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  31.97 
 
 		 942 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  88.2  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  31.69 
 
 		 316 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  34.27 
 
 		 851 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  28.97 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 		 584 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  31.68 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  35.65 
 
 		 552 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  25.87 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  32.67 
 
 		 585 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  33.91 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  22.07 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  27.97 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  30.93 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.68 
 
 		 1266 aa  54.7  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  27.03 
 
 		 342 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  25.97 
 
 		 364 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.24 
 
 		 1868 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  25 
 
 		 1048 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  28.12 
 
 		 137 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.94 
 
 		 947 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>