44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0460 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0460  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 
1729 aa  3516    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832377  normal  0.0598199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.98 
 
 
805 aa  77.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  22.37 
 
 
923 aa  71.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  21.45 
 
 
1148 aa  70.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.73 
 
 
2216 aa  68.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0923  hypothetical protein  29.31 
 
 
1041 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  22.11 
 
 
783 aa  66.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.33 
 
 
1044 aa  65.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.34 
 
 
1053 aa  65.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  28.3 
 
 
1002 aa  63.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  22.52 
 
 
1049 aa  61.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.16 
 
 
888 aa  62  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  20.42 
 
 
1345 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  22.31 
 
 
773 aa  58.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  19.96 
 
 
951 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  24.16 
 
 
1049 aa  57.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  21.12 
 
 
1064 aa  57.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.22 
 
 
1041 aa  57.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  20.22 
 
 
1349 aa  55.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  20.88 
 
 
1190 aa  55.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20.49 
 
 
942 aa  55.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.2 
 
 
1004 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.43 
 
 
798 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.56 
 
 
725 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  19.8 
 
 
762 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.24 
 
 
1044 aa  54.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  19.8 
 
 
762 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  21 
 
 
1201 aa  54.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.65 
 
 
1023 aa  53.5  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.71 
 
 
997 aa  53.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  17.31 
 
 
766 aa  52.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  19.64 
 
 
1339 aa  52.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  20.56 
 
 
801 aa  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  22.57 
 
 
1581 aa  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  22.28 
 
 
1150 aa  50.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  19.78 
 
 
1237 aa  50.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.71 
 
 
799 aa  50.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  22.75 
 
 
1007 aa  49.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.33 
 
 
1067 aa  49.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.95 
 
 
951 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.87 
 
 
1091 aa  47.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  23.38 
 
 
1216 aa  47.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20 
 
 
887 aa  46.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3605  NTPase (NACHT family)-like protein  30.88 
 
 
1225 aa  46.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.442586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>