41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0552 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  100 
 
 		 1004 aa  2058    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.48 
 
 		 911 aa  187  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.41 
 
 		 1443 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 1557 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.55 
 
 		 1766 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 1474 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1807 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.86 
 
 		 1868 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.9 
 
 		 1831 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.52 
 
 		 1901 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6430  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 998 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.24 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2000  hypothetical protein  25.9 
 
 		 768 aa  85.1  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3074  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.46 
 
 		 851 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.39797e-24 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0626  hypothetical protein  23.09 
 
 		 896 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 		 997 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  25.36 
 
 		 973 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.59 
 
 		 2216 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.87 
 
 		 942 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  24.14 
 
 		 818 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  33.11 
 
 		 773 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  23.29 
 
 		 1049 aa  51.2  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.38 
 
 		 944 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  23.68 
 
 		 751 aa  49.3  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  33.58 
 
 		 317 aa  47.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.72 
 
 		 911 aa  47.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.89 
 
 		 1067 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1339  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1060 aa  46.2  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  22.79 
 
 		 923 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.19 
 
 		 887 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.16 
 
 		 1053 aa  45.8  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31060  hypothetical protein  27.04 
 
 		 705 aa  45.8  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  23.48 
 
 		 1237 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  27.95 
 
 		 801 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1200 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.51 
 
 		 949 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.4 
 
 		 1041 aa  44.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  21.41 
 
 		 951 aa  44.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1065 aa  44.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.11 
 
 		 908 aa  44.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>