13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2000 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1589    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  25.9 
 
 		 1004 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.32 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.05 
 
 		 1831 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 		 1766 aa  55.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1557 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1474 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0626  hypothetical protein  26.5 
 
 		 896 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3074  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.7 
 
 		 851 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.39797e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.51 
 
 		 1443 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.9 
 
 		 1807 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1094 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.89 
 
 		 911 aa  44.3  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>