22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1339 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 1060 aa  2135    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1402  hypothetical protein  44.98 
 
 		 1080 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0215001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5397  hypothetical protein  37.72 
 
 		 1011 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4347  putative signal transduction protein with Nacht domain  35.06 
 
 		 1008 aa  344  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.647277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1338  ATPase  31.08 
 
 		 1000 aa  262  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.917741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  22.4 
 
 		 773 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  24.15 
 
 		 951 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.03 
 
 		 805 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25 
 
 		 1148 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  29.61 
 
 		 1237 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1807 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  24.01 
 
 		 799 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.91 
 
 		 1349 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  23.04 
 
 		 971 aa  48.1  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  27.15 
 
 		 1742 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  22.31 
 
 		 1004 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  27.94 
 
 		 1339 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 		 1766 aa  45.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.73 
 
 		 762 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.73 
 
 		 762 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  28.06 
 
 		 1345 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  29.58 
 
 		 2216 aa  44.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>