26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4347 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4347  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 1008 aa  2019    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.647277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1339  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1060 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5397  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1011 aa  334  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1402  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1080 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0215001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1338  ATPase  29.98 
 
 		 1000 aa  220  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.917741  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1033 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  22.47 
 
 		 959 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1807 aa  64.3  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  27.89 
 
 		 1766 aa  59.3  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.93 
 
 		 1901 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.85 
 
 		 908 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.24 
 
 		 783 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.63 
 
 		 762 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.63 
 
 		 762 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.45 
 
 		 1004 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  22.95 
 
 		 973 aa  51.6  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.08 
 
 		 798 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.9 
 
 		 725 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  28.38 
 
 		 1053 aa  47.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.39 
 
 		 942 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.13 
 
 		 951 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  26.16 
 
 		 900 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  23.3 
 
 		 971 aa  45.8  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  25.76 
 
 		 1049 aa  45.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  22.32 
 
 		 1345 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.19 
 
 		 1183 aa  44.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>