92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2994 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  882    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  62.85 
 
 
436 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  55.14 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  54.63 
 
 
432 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  36.2 
 
 
465 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  31.14 
 
 
894 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  29.75 
 
 
909 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  34.38 
 
 
888 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  30.13 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  30.56 
 
 
902 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  24.51 
 
 
466 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  30.17 
 
 
476 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  29.61 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  33.85 
 
 
1046 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  30.13 
 
 
1326 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  44.87 
 
 
1017 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  30.63 
 
 
1314 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4262  hypothetical protein  27.8 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.905098  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.27 
 
 
1309 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.03 
 
 
1324 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  58.33 
 
 
1311 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0302  ParA family protein  23.25 
 
 
257 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.36 
 
 
259 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0302  cell division inhibitor  23.25 
 
 
257 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01495  oxyanion-translocating ATPase  58.97 
 
 
582 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1136  cell division inhibitor  21.8 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0412072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 
308 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  24.73 
 
 
1098 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  30.56 
 
 
278 aa  50.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.01 
 
 
303 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  46.3 
 
 
603 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  45.76 
 
 
905 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 
294 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  37.5 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.35 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  37.5 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3447  cell division inhibitor  24.44 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2669  ParA family protein  24.44 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  28.95 
 
 
304 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 
254 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1254  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.21 
 
 
250 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
302 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  28.1 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3301  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.87 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  34.52 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  41.67 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  28.1 
 
 
269 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  41.27 
 
 
729 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  43.33 
 
 
640 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1654  arsenite-activated ATPase ArsA  52.27 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257726  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1491  arsenite-activated ATPase (arsA)  52.63 
 
 
587 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.738172  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.08 
 
 
310 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  31 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1992  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  27.5 
 
 
250 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2007  cell division inhibitor MinD  34.41 
 
 
270 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  26.51 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004087  septum site-determining protein MinD  30.13 
 
 
270 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000729512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  33 
 
 
308 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  35.06 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  31.41 
 
 
276 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  27.67 
 
 
292 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02926  hypothetical protein  37.7 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0453  ParA family protein  26.15 
 
 
255 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  27.81 
 
 
270 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.62 
 
 
537 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  36.23 
 
 
358 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1170  cell division inhibitor  21.5 
 
 
256 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.81 
 
 
270 aa  43.9  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2637  anion-transporting ATPase  48.78 
 
 
590 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473292  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  47.62 
 
 
267 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.98 
 
 
293 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  34.74 
 
 
374 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.22 
 
 
333 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3731  arsenite-activated ATPase ArsA  44.64 
 
 
600 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759868  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  32.41 
 
 
270 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  32.41 
 
 
270 aa  43.5  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1447  arsenite-transporting ATPase  47.73 
 
 
571 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.463523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  32.41 
 
 
270 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  29.41 
 
 
270 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  37.97 
 
 
605 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  30.85 
 
 
285 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  28.87 
 
 
251 aa  43.5  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
370 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  36.05 
 
 
318 aa  43.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.55 
 
 
338 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  28.66 
 
 
292 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  36.49 
 
 
438 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  32.53 
 
 
741 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_4593  predicted protein  43.1 
 
 
182 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0267902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3274  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.65 
 
 
259 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
298 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16719  predicted protein  43.1 
 
 
182 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>