28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6380 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  100 
 
 		 1017 aa  2050    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.62 
 
 		 1309 aa  163  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1046 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.46 
 
 		 1324 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  33.55 
 
 		 1326 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  32.85 
 
 		 1311 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  25.93 
 
 		 1314 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  54.29 
 
 		 888 aa  68.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  68.09 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  41.67 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  43.66 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  43.66 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  63.83 
 
 		 909 aa  61.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  63.64 
 
 		 902 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  31.21 
 
 		 465 aa  55.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  56.25 
 
 		 432 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  43.48 
 
 		 1098 aa  54.7  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  51.67 
 
 		 911 aa  52.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  41.18 
 
 		 466 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  44.87 
 
 		 435 aa  52  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  55.81 
 
 		 440 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.83 
 
 		 254 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  32.57 
 
 		 374 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  51.16 
 
 		 905 aa  48.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  44.87 
 
 		 436 aa  45.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.39 
 
 		 464 aa  44.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0302  cell division inhibitor  40.43 
 
 		 257 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0302  ParA family protein  40.43 
 
 		 257 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>