40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2173 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  878    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  30.03 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  29.14 
 
 		 902 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  34.64 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  32.98 
 
 		 894 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  30.69 
 
 		 909 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  31.87 
 
 		 888 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  32.18 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  29.83 
 
 		 476 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  30.13 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  29.15 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  26.5 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  31.54 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4262  hypothetical protein  24.24 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.905098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  27.76 
 
 		 1098 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1046 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1254  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.39 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  26.98 
 
 		 1309 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0302  ParA family protein  25.79 
 
 		 257 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0302  cell division inhibitor  25.79 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1136  cell division inhibitor  24.75 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0412072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2798  cell division inhibitor  23.67 
 
 		 251 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.208643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0220  cell division inhibitor MinD  27.63 
 
 		 252 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.32 
 
 		 1324 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3447  cell division inhibitor  23.38 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2669  ParA family protein  23.38 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  55.81 
 
 		 1017 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  45.31 
 
 		 1326 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1170  cell division inhibitor  25.3 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  27.07 
 
 		 1311 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  21.28 
 
 		 266 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  30.06 
 
 		 1314 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1586  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0407218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.27 
 
 		 254 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.67 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3570  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 265 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00412685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>