22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4262 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4262  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.905098  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  37.14 
 
 
909 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  37.76 
 
 
888 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  34.08 
 
 
894 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  24.06 
 
 
902 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  24.24 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  27.7 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  30 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  29.5 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  27.27 
 
 
466 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  27.8 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  27.84 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2798  cell division inhibitor  24.22 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.208643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 
259 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  25.84 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1586  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.96 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0407218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  20.81 
 
 
1098 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  27.54 
 
 
1324 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  22.6 
 
 
1311 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2669  ParA family protein  23.45 
 
 
252 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3447  cell division inhibitor  23.45 
 
 
252 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>