43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1614 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  951    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  36.36 
 
 
432 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  36.2 
 
 
435 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  34.77 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  37.34 
 
 
436 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 
894 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  31.54 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  29.41 
 
 
902 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  28.86 
 
 
909 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  29.29 
 
 
888 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  31.61 
 
 
1046 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  25.47 
 
 
472 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  25.47 
 
 
476 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.96 
 
 
1324 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  26.84 
 
 
466 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  31.21 
 
 
1017 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  25.45 
 
 
1309 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.76 
 
 
1314 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  55.56 
 
 
1098 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  44.62 
 
 
1311 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.2 
 
 
1326 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.26 
 
 
911 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  40.62 
 
 
905 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.05 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
312 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  36.47 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.49 
 
 
281 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3731  arsenite-activated ATPase ArsA  51.16 
 
 
600 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759868  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 
741 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  41.94 
 
 
753 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1347  arsenite-activated ATPase ArsA  48.84 
 
 
586 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  48.65 
 
 
603 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  23.19 
 
 
257 aa  44.3  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
446 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  30 
 
 
766 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1056  chromosome partitioning ATPase  32.05 
 
 
457 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  hitchhiker  0.00567029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  45.28 
 
 
309 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 
210 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01495  oxyanion-translocating ATPase  51.35 
 
 
582 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2513  arsenite-activated ATPase ArsA  46.51 
 
 
586 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.67 
 
 
301 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2947  chromosome partitioning ATPase  42.55 
 
 
294 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000147107  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
263 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>