138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  862    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  63.06 
 
 
435 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  59.12 
 
 
432 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  57.14 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  37.34 
 
 
465 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  32.66 
 
 
909 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  30.77 
 
 
894 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  32.18 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  35.79 
 
 
888 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  30.9 
 
 
472 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  30.9 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  26.84 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  29.94 
 
 
902 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  32.66 
 
 
1046 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  31.3 
 
 
1326 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.97 
 
 
1309 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.84 
 
 
1314 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.1 
 
 
1311 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30.46 
 
 
1324 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  44.87 
 
 
1017 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4262  hypothetical protein  25.84 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.905098  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  27.88 
 
 
1098 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  27.48 
 
 
905 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.4 
 
 
537 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 
308 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4928  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  40.22 
 
 
283 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3301  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.78 
 
 
279 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
294 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  47.62 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  27.11 
 
 
266 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0209  arsenite-activated ATPase ArsA  51.22 
 
 
621 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2947  chromosome partitioning ATPase  29.76 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000147107  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  47.62 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  31.72 
 
 
304 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2669  ParA family protein  24.06 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  26.19 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.99 
 
 
911 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3447  cell division inhibitor  24.06 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  27.04 
 
 
364 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0742  putative MinD-related protein  28.51 
 
 
296 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  45.24 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  45.24 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 
309 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.98 
 
 
261 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
254 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1136  cell division inhibitor  25.29 
 
 
263 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0412072 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0267  anion-transporting ATPase  31.13 
 
 
384 aa  47  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138882  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
303 aa  47.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  36.59 
 
 
372 aa  47  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  26.75 
 
 
741 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  31.45 
 
 
384 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.49 
 
 
259 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01495  oxyanion-translocating ATPase  51.28 
 
 
582 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  32.71 
 
 
290 aa  46.6  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  26.53 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  27.21 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  33.1 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2570  Arsenite-transporting ATPase  31.2 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  41.51 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  33.33 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.07 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  40.78 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  28.8 
 
 
373 aa  45.8  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  40.78 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.94 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.92 
 
 
291 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  47.62 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  41.51 
 
 
603 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  31.2 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.58 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0217  anion-transporting ATPase  29.6 
 
 
385 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  28.48 
 
 
269 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  28.48 
 
 
269 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  28.67 
 
 
268 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  24.61 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  40.78 
 
 
333 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  29.25 
 
 
270 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  29.25 
 
 
270 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  29.25 
 
 
270 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 
274 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  29.03 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  31.13 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2007  cell division inhibitor MinD  30.19 
 
 
270 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  27.81 
 
 
269 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  26.67 
 
 
270 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  27.81 
 
 
269 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2372  cell division inhibitor MinD  25.33 
 
 
270 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000838785  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  42.86 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  26.32 
 
 
269 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  48.65 
 
 
434 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  30.3 
 
 
364 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  30.72 
 
 
265 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.19 
 
 
272 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  38.1 
 
 
285 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  27.97 
 
 
313 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  28.3 
 
 
270 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3338  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
285 aa  43.9  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>