More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3338 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3338  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4928  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  53.28 
 
 
283 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3963  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  53.02 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3883  putative plasmid partitioning protein Soj  50 
 
 
280 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3301  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.1 
 
 
279 aa  278  8e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3098  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.65 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  33.65 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.38 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.38 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.38 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.23 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  27.75 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.35 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3274  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4774  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.03 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  29.73 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  26.89 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.33 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  28.44 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.83 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.19 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.48 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  28.72 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
352 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.6 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  30.05 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  30.65 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  32.29 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.88 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  28.44 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5116  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.98 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  28.1 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.7 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.7 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24.76 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.042281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  30.81 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.46 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.46 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N36  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.05 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  30.81 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  36.08 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  30.73 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  29.85 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4522  chromosome partitioning ATPase  27.85 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.64 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000524469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  29.73 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  33.16 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC58  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  30.11 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.85 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>