More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0742 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0742  putative MinD-related protein  100 
 
 
296 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  32.85 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  32.85 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
297 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 
271 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.07 
 
 
293 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1248  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  33.85 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  30.95 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 
311 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.15 
 
 
308 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1312  putative MinD-related protein  34.72 
 
 
309 aa  142  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.17 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
309 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  31.41 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 
276 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  30.11 
 
 
304 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  33.46 
 
 
280 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 
277 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  30.6 
 
 
295 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  30.8 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  28.98 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  30.25 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.83 
 
 
333 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1863  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.69 
 
 
295 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0949609  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2961  flagellar biosynthesis protein FlhG  34.22 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.0900625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  30.86 
 
 
274 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2837  flagellar biosynthesis protein, FlhG  35.16 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0270  flagellar biosynthesis protein, FlhG  35.16 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0252  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  35.16 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  30.27 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  30.99 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3373  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  35.16 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209215  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
277 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  29.63 
 
 
277 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
277 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
277 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  32.24 
 
 
294 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  32.24 
 
 
294 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  28.88 
 
 
288 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 
310 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  28.06 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  30.04 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  30.04 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 
288 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.67 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.92 
 
 
301 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2844  flagellar biosynthesis protein FlhG, putative  35 
 
 
270 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0060  flagellar biosynthesis protein FlhG  35 
 
 
270 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3841  putative flagellar protein  35 
 
 
270 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.32 
 
 
293 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3922  putative flagellar protein  35 
 
 
270 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3131  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  35 
 
 
270 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3420  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  35 
 
 
270 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1698  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  35 
 
 
270 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 
293 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  28.81 
 
 
283 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 
293 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.89 
 
 
302 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.96 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0178  flagellar biosynthesis protein, FlhG  33.46 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0184  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  32.73 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0197  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  32.73 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302585  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  23.95 
 
 
295 aa  112  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3167  flagellar biosynthesis protein FlhG, putative  33.85 
 
 
270 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.74 
 
 
302 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4143  flagellar biosynthesis protein FlhG  31.95 
 
 
300 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 
293 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3801  flagellar biosynthesis protein FlhG  29.1 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.21 
 
 
306 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
519 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0133  flagellar biosynthesis protein FlhG  29.51 
 
 
275 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
306 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000469993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5618  flagellar biosynthesis protein FlhG  29.89 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.78 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.18 
 
 
370 aa  92.4  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.04 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>