More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1248 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1248  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.31 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  32.05 
 
 		 304 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0742  putative MinD-related protein  33.85 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  33.84 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.19 
 
 		 343 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.64 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.86 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 370 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  31.43 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  31.43 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 		 308 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 		 293 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  29.8 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  29.8 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  27.24 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  27.24 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  28.28 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3701  flagellar biosynthesis protein FlhG  36.8 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216726  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.52 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  31.85 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  27.89 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  31.85 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  26.88 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.53 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 293 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 293 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 293 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 293 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  27.49 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  25.1 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  27.13 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1312  putative MinD-related protein  31.25 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  26.53 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  28.46 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  29.24 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.18 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1863  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0949609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.97 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5618  flagellar biosynthesis protein FlhG  33.33 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 		 519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.49 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  28.46 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  22.39 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1280  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.05 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.22 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  22.18 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.3 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.39 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 		 294 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2844  flagellar biosynthesis protein FlhG, putative  32.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3922  putative flagellar protein  32.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3131  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  32.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0060  flagellar biosynthesis protein FlhG  32.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1698  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  32.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3841  putative flagellar protein  32.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3420  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  32.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4143  flagellar biosynthesis protein FlhG  31.91 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3801  flagellar biosynthesis protein FlhG  32.5 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0133  flagellar biosynthesis protein FlhG  32.54 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  25 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>